Le Conseil administratif est le pouvoir exécutif de la commune. Il est composé de trois membres (un Maire et deux Conseillers administratifs). Le Maire change chaque année au 1er juin. Le Conseil administratif est élu pour une période de cinq années (législature). Les prochaines élections administratives se dérouleront en 2025, les dernières ayant eu lieu au printemps 2020.
A Vernier, les séances du Conseil administratif ont lieu en principe une fois par semaine, le mardi après-midi à 14h30; elles se déroulent dans la salle du Conseil administratif qui se situe au rez-de-chaussée de la mairie, au 9, rue du Village à Vernier. Les séances du Conseil administratif se font à huis clos.
Depuis le 1er novembre 2018, le représentant du Parti Socialiste à la Mairie de Vernier est Martin Staub.
